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进化算法及其在生物信息中的应用 - 龙海侠,吴兴惠
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5.4 仿真实验及其结果
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2024-04-30 10:30:07
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封面
版权信息
前言
第1章 绪论
1.1 进化算法
1.2 生物信息学
1.3 最优化理论
1.4 本书的主要内容
第2章 粒子群优化算法和量子粒子群优化算法
2.1 粒子群优化算法
2.2 量子粒子群优化算法
2.3 QPSO算法收敛性分析
第3章 基于选择操作的QPSO算法
3.1 引言
3.2 采用锦标赛选择操作的QPSO算法(QPSO-TS)
3.3 采用轮盘赌选择操作的QPSO算法(QPSO-RS)
3.4 算法的收敛性分析
3.5 实验结果及分析
3.6 本章小结
第4章 进化算法在多序列比对中的应用
4.1 多序列比对的含义
4.2 基于二进制QPSO算法的序列比对
4.3 基于隐马尔柯夫模型和多样性QPSO算法的多序列比对
第5章 基于进化算法的代谢流的评估
5.1 代谢流评估
5.2 基于自适应进化算法和单值分解的方法的代谢通量分析
5.3 基于QPSO及其改进的QPSO算法和罚函数的代谢通量分析
5.4 仿真实验及其结果
5.5 本章小结
第6章 基于GP和QPSO算法的兽疫链球菌发酵透明质酸培养基的优化
6.1 引言
6.2 原料和方法
6.3 响应面分析法(RSM)
6.4 仿真实验和结果
6.5 结论
第7章 基于多样性量子行为粒子群优化算法的基因数据聚类
7.1 基因数据聚类研究现状
7.2 多样性引导的量子粒子群优化算法
7.3 基于DGQPSO的聚类算法设计
7.4 基于多样性量子行为粒子群算法的基因数据聚类
7.5 结论
第8章 总结与展望
附录1 PSO算法程序代码
附录2 QPSO算法程序代码
附录3 多序列比对程序代码
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